In uitvoering van de regeringsbeslissing van 30 november 2016 over de Instandhoudingsdoelstellingen (IHD) en de Programmatische Aanpak Stikstof (PAS) is het Instandhoudingsbesluit van 20 juni 2014 gewijzigd. De aanpassingen gaan over de wijze om de zoekzones te bepalen en moeten resulteren in kleinere zoekzones.

- De definitie van ‘passend beheer’ is voortaan ruimer. Ook overeenkomsten die het passend beheer beschrijven komen nu in aanmerking om het openstaand saldo aan doelen te verkleinen. Voorheen gold dat enkel voor goedgekeurde natuurbeheerplannen.
- Voor de berekening van de vereiste oppervlakte van de zoekzones, vertrekkend van het openstaand saldo aan doelen, zijn de vermenigvuldigingsfactoren voortaan kleiner.

De Vlaamse regering maakte van de gelegenheid gebruik om een aantal andere aanpassingen door te voeren.

- Nuancering van de inhoudstafel van het managementplan, in verband met het aspect verbetering van het natuurlijk milieu.
- De formulering van de samenstelling van de gewestelijke overleginstantie werd op punt gesteld.
- In het oorspronkelijke besluit was aan administratieve overheden een deadline opgesteld voor de opmaak van een natuurbeheerplan. Deze deadline is in overeenstemming gebracht wat het natuurdecreet hierover voorschrijft. De oorspronkelijk ingeschreven deadline van 31 december 2017 is daarmee geschrapt.

Het gewijzigd Instandhoudingsbesluit is goedgekeurd door de Ministerraad van 16 juni 2017.